本所欲藉由申請IEET（工程認證）以提升教學品質與學生學習成效。系所如欲通過認證，其教育目標之制定需由在校學生、所友、業界、學界、學生家長等共同制定，以反應實際需求，落實社會脈動。亦即系所在修訂課程時是採開放政策，非以往閉門造車方式制定，制定後之教育目標需與培育學生之八大競爭核心能力相關聯。 本所制定教育目標如下： 1.具環境工程專業技術能力：藉由空氣污染控制技術、燃燒與焚化技術、除臭技術、固液廢棄物處理、資源化技術及土壤/地下水污染整治技術等專業實務課程之訓練，培育出具備環工專業技能之人才。 2.培育高階環工管理及規劃人才：透過各項進階課程如淨水高級處理程序、水資源管理與自來水系統、風險評估、環境系統分析課程及專題研究之課程訓練，培育出具備環工高階管理、規劃及具備獨立學術研究、思考、創新、創意、技術開發、決策及領導能力之人才。 3.團隊合作與環境倫理：藉由研究計畫之參與及書報討論、環境倫理學等課程之修習，再配合指導教授之專題討論，以輔導研究生具備團隊合作之精神與環境倫理之概念。 4.永續環境經營之能力：為因應下一世紀之環境工程專業之發展及環境保護之需求，故開設奈米科技與環境、電子業污染與防制、先進能源、廢棄物自然處理系統及環境影響評估等課程，讓學生具備綠色永續及先進環境工程技術之概念及能力。 5.國際視野的培育：開設國際環保議題課程及英文寫作相關課程，舉辦國際學術研討會，並鼓勵學生在學期間赴國外大學進行短期修課與研究，同時獎勵補助學生出席國際學術研討會並發表研究成果。 另外本所藉由此計畫，輔導學生建立下述之環工核心能力： 1.運用環工領域、數學、科學及工程知識之能力。 2.設計與執行環工相關之實驗，並培養分析與解釋數據的能力。 3.使用適當工具、技術解決環工實務工程所需。 4.設計環工工程元件、系統或製程之能力。 5.建立團隊合作及有效溝通的能力。 6.觀察、發掘，分析及處理問題的能力。 7.認識時事議題，瞭解工程技術對環境、社會及全球的影響，並培養持續學習的習慣與能力。 8.理解環工倫理及社會責任。